本周出版的英國(guó)《自然》雜志上發(fā)表的一項(xiàng)傳染病學(xué)研究論文，描述了一個(gè)可以被裝入行李箱并運(yùn)輸?shù)浆F(xiàn)場(chǎng)使用的埃博拉病毒基因組測(cè)序監(jiān)測(cè)系統(tǒng)，這個(gè)系統(tǒng)在收集樣本后24小時(shí)內(nèi)就可以得出結(jié)果。該論文還介紹了在西非幾內(nèi)亞最近的埃博拉疫情中成功使用這個(gè)系統(tǒng)進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)疫情的案例。


在監(jiān)控疫情方面，病毒基因組測(cè)序獲取的信息有助于了解病毒在大規(guī)模傳播過程中出現(xiàn)了何種變異，這對(duì)判斷疫情發(fā)展趨勢(shì)非常重要。但由于病毒傳播速度快，如何更快、更高效地完成相關(guān)分析流程就成為關(guān)鍵。


英國(guó)伯明翰大學(xué)的尼古拉斯·羅曼和他的研究團(tuán)隊(duì)此次開發(fā)的基因組監(jiān)測(cè)系統(tǒng)，使用的是一個(gè)重量小于100克的DNA測(cè)序裝置，可以用標(biāo)準(zhǔn)的航空行李運(yùn)送，也可以插入筆記本電腦的USB接口。研究團(tuán)隊(duì)使用該系統(tǒng)測(cè)序分析了142個(gè)從2015年3月份到10月份收集的埃博拉病毒樣本。研究人員發(fā)現(xiàn)，他們可以在24小時(shí)內(nèi)得到分析結(jié)果，測(cè)序過程只需要不到一小時(shí)。


在去年埃博拉肆虐期間，該系統(tǒng)曾被率先部署在西非國(guó)家?guī)變?nèi)亞的一個(gè)疫區(qū)。研究人員在埃博拉患者身上收集到樣本后，在現(xiàn)場(chǎng)利用這個(gè)系統(tǒng)進(jìn)行病毒基因組測(cè)序，無需再把這些樣本長(zhǎng)途運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室。


研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為，這一系統(tǒng)顯示出在資源缺乏的情況下進(jìn)行實(shí)時(shí)基因組監(jiān)控是可行的，并且該設(shè)施可以被迅速建立起來以便監(jiān)測(cè)疫情。


報(bào)告作者之一、伯明翰大學(xué)學(xué)者尼克·洛曼說，基因組測(cè)序反映的信息在疫情暴發(fā)期間對(duì)研究人員來說非常重要，以往這項(xiàng)繁瑣工作只能在配備大型設(shè)備的實(shí)驗(yàn)室里才能完成，而便攜式測(cè)序裝置有望改變這種狀況。